醫療保險和合作醫療是不一樣的，醫療保險通常是指職工醫保或城鎮居民醫保，而合作醫療則是針對農民設立的醫療保障制度，兩者的參保對象不一樣，且享受的報銷范圍、比例也存在差別。

不過，醫療保險和合作醫療以后會合并、統一，讓城鄉居民都能享受到一樣的醫保待遇與保障，在統一前參保其中一個即可，若是參保兩個也不能疊加享受報銷。